У истоков создания журнала «Рациональная Фармакотерапия в Кардиологии» стояли д.м.н., профессор кафедры нефрологии и гемодиализа ФППОВ Первого Московского государственного медицинского университета им. И.М. Сеченова В.А. Рогов и директор Государственного научно-исследовательского центра профилактической медицины (ГНИЦ ПМ, ныне Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины) - академик РАН, д.м.н., профессор Р.Г. Оганов. Большой вклад в становление и развитие журнала внесли сотрудники ГНИЦ ПМ д.м.н., профессор С.Ю. Марцевич и д.м.н., профессор С.А. Шальнова.
С 2005 по 2015 гг. главным редактором журнала являлся Рафаэль Гегамович Оганов. В 2016 году новым главным редактором был избран директор ГНИЦ ПМ, д.м.н., профессор Сергей Анатольевич Бойцов, в настоящее время - академик РАН, директор Национального медицинского исследовательского центра Кардиологии. С 2023 года главным редактором журнала является директор ГНИЦ ТПМ, академик РАН, д.м.н., профессор Оксана Михайловна Драпкина.
Вехи развития журнала:
2007 год: журнал включен в Перечень изданий Высшей Аттестационной Комиссии (ВАК).
2008 год: включен в систему Российского индекса научного цитирования (РИНЦ).
2011 год: включен в базу данных периодических изданий Ulrich's Periodicals Directory.
2012 год: включен в биомедицинскую и фармакологическую библиографическую базу данных EMBASE, а также в каталог рецензируемых журналов открытого доступа - DOAJ.
2016 год: включен в международную базу данных Web of Science (ESCI).
2017 год: включен в международную базу цитирования Scopus.
Журнал «Рациональная Фармакотерапия в Кардиологии» является одним из лидеров среди кардиологических журналов России. На протяжение всех лет Редакция журнала руководствуется принципами строгого отбора материалов, независимого рецензирования, следования международным правилам и стандартам публикации биомедицинских исследований.
С момента основания журнал «Рациональная Фармакотерапия в Кардиологии» издавался обществом с ограниченной ответственностью «Столичная Издательская Компания» (ООО «СТИКОМ»). С 2023 года журнал издается обществом с ограниченной ответственностью «СИЛИЦЕЯ - ПОЛИГРАФ».